Profesores Responsables
Dra. Angélica Rueda y Sánchez de la Vega
Dr. Jesús Valdés Flores
Dr. Edgar Morales Ríos
Objetivo
El objetivo principal de este curso es que cada estudiante conozca e identifique las propiedades fundamentales de estructura, función y estabilidad de los ácidos nucleicos y las proteínas. Este curso pretende sentar las bases bioquímicas para la comprensión de las temáticas a tratar en los cursos subsecuentes.
Justificación
Desde los experimentos clásicos de Bernal en la década de los 30's, fue evidente que las macromoléculas tienen forma física definida. La importancia del desarrollo de técnicas para obtener información estructural es tipificada por los premios Nobel dados a Perutz y Krendew por el desarrollo de la cristalografía de proteínas, a Klug por sus estudios sobre microscopía electrónica y a Wüthrich por la resonancia magnética nuclear aplicada a macromoléculas. Sin embargo, la biología estructural moderna no solamente se enfoca a los métodos para la obtención de información estructural, sino que está enfocada a experimentos que ligan la estructura de una macromolécula con su función. Esto se ejemplifica en los premios Nobel dados a Watson, Crick, Deisenhofer, Huber, Michel, Walker y recientemente a MacKinnon.
La bioquímica estructural moderna no solo nos permite entender sistemas biológicos complejos, sino que nos permite su manipulación. Lo anterior es evidente en el amplio desarrollo de la ingeniería de proteínas y el diseño racional de drogas como tecnologías recientes.
La bioquímica como ciencia es multidisciplinaria y el tener conocimientos básicos de biología estructural ampliará la perspectiva del alumno en su entender sobre sistemas biológicos complejos.
Requisitos
Aprobar los cursos propedéuticos o su equivalente.
Duración
5 semanas, en sesiones de 3 horas 3 veces a la semana. En total, 45 horas.
Temario
PROTEÍNAS I
Dra. Angélica Rueda y Sánchez de la Vega
Duración: 2 semanas.
- Propiedades de los aminoácidos.
- Estructura del enlace peptídico.
- Métodos bioquímicos para el estudio de las proteínas (cromatografía, electroforesis, técnicas de espectrofotometría, fluorescencia).
- Estructura primaria de las proteínas (secuencia, homología).
- Investigación en proteínas y proteomas: utilización de bases de datos, herramientas y software on-line para el estudio de péptidos y proteínas.
- Evolución molecular de las proteínas y el uso de la bioinformática. Proteínas homólogas, ortólogas y parálogas.
- Exploración de la función y estructura de algunas proteínas de interés en el Departamento de Bioquímica.
- Mi proteína en clase: cada estudiante realiza y presenta el análisis bioinformático de una proteína en particular.
ACIDOS NUCLÉICOS
Dr. Jesús Valdés Flores
Duración: 1 semana.
- Flujo de la información genética.
- Estructura y función de los ácidos nucleicos.
- mRNA, marco abierto de lectura y mutaciones.
- PCR cuantitativa en tiempo real.
PROTEÍNAS II
Dr. Edgar Morales Ríos
Duración: 2 semanas.
- Mecanismos de plegamiento/desplegamiento de proteínas.
- Estructura secundaria de las proteínas: Métodos experimentales y computacionales.
- Estructura terciaria y cuaternaria de las proteínas: Técnicas y métodos experimentales. Software para determinación, interpretación y análisis de estructuras moleculares.
- Mi proteína en clase II: cada estudiante realiza y presenta el análisis estructural de una proteína en particular con lo aprendido en este módulo.
Mecanismos de evaluación
La asistencia puntual a las clases de este curso es obligatoria. La calificación final se obtiene al promediar las evaluaciones entregadas por cada profesor.
Bibliografía
- Buxbaum, Engelbert. (2007). Fundamentals of Protein Structure and Function. Parte I. Spring Boston MA.
- Lehninger. Principles of Biochemistry. Fifth or Sixth Edition.
- Petsko, Gregory A. (2004). Protein structure and function. New Science Press. London, UK.
- Sheehan, David (2009). Physical Chemistry. Principles and Applications. 2nd Edition. John Wiley and Sons Ltd, West Sussex, UK. (Chapters 2, 3, and 5).
- Stryer, Berg and Tymoczko. (2013). Bioquímica con aplicaciones clínicas. Séptima Edición. Editorial Reverté. España. (Capítulos 3 y 6).